（一）本罪与非罪的区别
依本条之规定，生产、销售伪劣农药、兽药、化肥、种子，只有使生产遭受较大损失的，才构成本罪。如果没有使生产遭受较大损失的，就不构成本罪[www.mas64.com]。另外，行为人生产、销售伪劣农药、兽药、化肥、种子，虽没有使生产遭受较大损失的，但销售数额在五万元以上的，应按生产、销售伪劣产品罪定罪处罚。生产、销售伪劣农药、兽药、化肥、种子，构成生产、销售伪劣农药、兽药、化肥、种子罪，同时又构成生产、销笛伪劣产品罪的，依照处罚较重的规定处罚。
（二）本罪与破坏生产经营罪的区别
认定本罪要注意与破坏生产经营罪的区别。其主要是：（1）本罪一般是出于非法牟利的目的，后罪则是出于泄愤报复或者其他个人目的；（2）本罪在客观方面一现为生产、销售伪劣农药、兽药、化肥、种子并使生产遭受较大损失的行为[www.mas64.com]。[马鞍山刑事律师mas64.com]。
